独立行政法人福祉医療機構は、社会福祉事業施設及び病院、診療所等の設置等に必要な資金の融通並びにこれらの施設に関する経営指導等を行い、もって福祉の増進並びに医療の普及及び向上を図ることを目的としています。
また、その業務に必要な資金の調達手段として、独立行政法人福祉医療機構法において、財政融資資金の借入及び財投機関債の発行が認められています。